Mula sa simula ng pandemya, ang pagsusuri sa diagnostic ay may mahalagang papel sa pagkontrol sa pagkalat ng SARS-CoV-2, ang virus na nagdudulot ngCOVID 19.Mabilis na pagsusuri ng antigenna ginagawa sa bahay o sa isang klinikal na setting ay nagbibigay ng mga resulta sa loob ng 15 minuto o mas kaunti.Kung mas maagang na-diagnose ang isang tao, mas maaga silang maaaring humingi ng medikal na atensyon at ihiwalay ang kanilang sarili sa iba.Ngunit kapag lumitaw ang mga bagong variant ng virus, ang mga variant na iyon ay maaaring hindi matukoy ng mga pagsubok na ito.
Karamihan sa mga mabilis na pagsusuri sa antigen ay idinisenyo upang makita ang SARS-CoV-2 nucleocapsid protein o N-protein.Ang protina na ito ay matatagpuan sa kasaganaan sa mga viral particle at mga nahawaang tao.Rapid test kits ay karaniwang naglalaman ng dalawang magkaibang diagnostic antibodies na nagbubuklod sa iba't ibang bahagi ng N protein.Kapag ang isang antibody ay nagbubuklod sa N protein sa isang sample, isang may kulay na linya o iba pang signal ang lalabas sa test kit, na nagpapahiwatig ng isang impeksiyon.
Ang Protein N ay binubuo ng 419 amino acid structural units.Anuman sa kanila ay maaaring mapalitan ng isa pang amino acid sa pamamagitan ng mutation.Research group na pinamumunuan ng Ph.D.Sina Philip Frank at Eric Ortlund ng Emory University ay nagtakdang mag-imbestiga kung paano nakakaapekto ang nag-iisang pagbabago sa amino acid sa pagganap ng isang mabilis na pagsusuri sa antigen.Gumamit sila ng pamamaraan na tinatawag na deep mutation scanning upang sabay-sabay na masuri kung paano nakakaapekto ang bawat mutation sa N protein ng virus sa pagbubuklod sa isang diagnostic antibody.Na-publish ang kanilang mga resulta sa Cell noong Setyembre 15, 2022.
Ang mga mananaliksik ay lumikha ng isang komprehensibong library ng halos 8,000 N protein mutations.Ang mga variant na ito ay nagkakahalaga ng higit sa 99.5% ng lahat ng posibleng mutasyon.Pagkatapos ay sinuri nila kung paano nakipag-ugnayan ang bawat variant sa 17 iba't ibang diagnostic antibodies na ginagamit sa 11 na available na komersyal na mabilis na pagsusuri ng antigen, kabilang ang karaniwangmga gamit sa bahay.
Sinuri ng koponan kung aling mga mutasyon ng N-protein ang nakakaapekto sa pagkilala sa antibody.Batay sa impormasyong ito, gumawa sila ng "escape mutation profile" para sa bawat diagnostic antibody.Tinutukoy ng profile na ito ang mga partikular na mutasyon sa N protein na maaaring makaapekto sa kakayahan ng antibody na magbigkis sa target nito.Ang pagsusuri ay nagpakita na ang mga antibodies na ginagamit sa mga mabilis na pagsusuri ngayon ay kinikilala at nagbubuklod sa lahat ng nakaraan at kasalukuyang mga variant ng SARS-CoV-2 ng pag-aalala at pag-aalala.
Bagama't kinikilala ng ilang mga diagnostic antibodies ang parehong rehiyon ng protina ng N, natuklasan ng mga mananaliksik na ang bawat antibody ay may natatanging pirma ng escape mutations.Habang patuloy na nagmu-mutate at bumubuo ng mga bagong variant ang SARS-CoV-2 virus, magagamit ang data na ito para i-flag ang mga antibodies sa test kit na maaaring kailangang suriing muli.
"Ang tumpak at mahusay na pagkilala sa mga nahawaang indibidwal ay nananatiling isang kritikal na diskarte para sa COVID-19 mitigation, at ang aming pag-aaral ay nagbibigay ng impormasyon sa hinaharap na mga mutation ng SARS-CoV-2 na maaaring makagambala sa pagtuklas," sabi ni Ortlund."Ang mga resulta na nakabalangkas dito ay nagpapahintulot sa amin na mabilis na umangkop sa virus na ito habang ang mga bagong variant ay patuloy na lumalabas, na nagpapakita ng agarang klinikal at pampublikong implikasyon sa kalusugan."
Background: Nakikita ng Mutation Deep Scan ang mga escape mutations sa SARS-CoV-2 nucleocapsid gamit ang kasalukuyang available na rapid antigen tests.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA cell.2022 Setyembre 15;185(19):3603-3616.e13.Ministri ng Panloob: 10.1016/j.cell.2022.08.010.Agosto 29, 2022 PMID: 36084631.
Pagpopondo: National Institute for Biomedical Imaging and Bioengineering NIH (NIBIB), National Institute of Diabetes, Digestive and Kidney Diseases (NIDDK) at National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), American Heart Association.
Ang NIH Research Matters ay isang lingguhang pag-update ng mga pangunahing natuklasan sa pananaliksik ng NIH na sinuri ng mga eksperto sa NIH.Ito ay inilathala ng Communications and Public Affairs Office ng Direktor ng National Institutes of Health.